No dia 30 de junho de 2004, Abel Braga passava por uma das maiores tristezas em sua trajetória no futebol. Comandando o Flamengo, ele perdeu a final da Copa do Brasil para o Santo André no Maracanã com mais de 72 mil pessoas.
"Foi a maior decepção na minha carreira. Foi o jogo de uma torcida só e foi horrível ver o estádio calado após os gols do Santo André", afirmou o treinador, que está de volta à Gávea, ao Bola da Vez.
Naquele torneio, a equipe do ABC Paulista eliminou Novo Horizonte-GO, Atlético-MG, Guarani-SP, Palmeiras e XV de Campo Bom-RS antes de enfrentar o time rubro-negro na decisão. Depois de empatar por 2 a 2 no antigo Palestra Itália, venceu por 2 a 0 no Rio de Janeiro para ser o campeão da competição.
Quase 15 anos depois de conseguir o maior feito de sua história, o que aconteceu com o Santo André?
Logo depois da Copa do Brasil, o time perdeu 12 pontos na Série B do Brasileiro, mas mesmo assim quase se classificou para a fase final da competição.
Na Libertadores da América de 2005, não passou da primeira fase, mas empatou com o Palmeiras fora de casa e depois venceu o time alviverde no Bruno Daniel. Além disso, fez 6 a 0 no Deportivo Táchira, da Venezuela, na maior goleada daquela edição.
A equipe se manteve na Série A 1 do Paulista até 2007, quando foi rebaixada. Na Série B daquele ano, passou por mudanças com a criação de uma empresa para gerir o futebol. Escapou da degola com uma base de jogadores veteranos como Marcelinho Carioca e Fernando. No ano seguinte, conseguiu dois acessos: foi campeão da Série A2 do Paulista e vice-campeão da Série B, sendo a única equipe que não perdeu para o campeão Corinthians.
Em 2009, ficou em sexto no Paulista e jogou a elite do Brasileiro depois de 25 anos. Apesar de ter conquistado alguns bons resultados e ter revelado jogadores como Ricardo Goulart, não conseguiu ficar na primeira divisão e acabou rebaixado na última rodada após ter sido derrotado pelo Internacional no Beira-Rio.
No Paulista do ano seguinte veio a redenção. Com um time que ficou com a segunda melhor campanha na primeira fase, eliminou o Grêmio Prudente na semifinal antes de pegar o Santos na decisão.
Contra o time de Neymar e Ganso, o Ramalhão perdeu o primeiro jogo por 3 a 2 e venceu o segundo jogo pelo mesmo placar, mas ficou com o vice por ter piro campanha que os santistas. A equipe do ABC acabou prejudicada por um gol mal anulado, depois viu Arouca salvar uma bola em cima da linha e ainda meteu uma bola na trave aos 44 do 2º tempo.
Após o desmanche sofrido logo em seguida e inúmeros problemas de administração, o clube acumulou sucessivos rebaixamentos no Brasileiro e ficou sem divisão nacional a partir de 2013. Neste ano, o futebol voltou para as mãos do clube social.
No Paulista, caiu para a Série A2 em 2011 e ficou por lá até 2016. Mesmo problemas de salários atrasados, a equipe se classificou na oitava posição e eliminou o favorito - e arquirrival - São Caetano. Eliminou todos os adversários fora de casa e conquistou o torneio contra o Mirassol.
No Estadual de 2017, venceu o Corinthians em plena Arena de Itaquera por 2 a 0, mas só escapou do rebaixamento de forma dramática na última rodada. Venceu o Grêmio Osasco Audax fora de casa de virada por 2 a 1.
Para o ano seguinte, o Santo André apostou no treinador Sérgio Soares. Ex-jogador da equipe do ABC, ele foi auxiliar no título da Copa do Brasil e treinador no acesso para a Série A do Brasileiro em 2008, no vice-paulista de 2010 e ajudou a escapar da degola.
Em 2018, porém, não repetiu o mesmo sucesso de outras campanhas. O time conseguiu somente uma vitória em todo Estadual (2 a 1 de virada sobre o Corinthians) e acabou rebaixada outra vez. No começo deste ano, Jairo Livólis, presidente na Copa do Brasil de 2004 e que comandava o clube, faleceu com problemas de saúde.
Além da Série A2 de 2016, a equipe faturou a Copa Paulista de 2014 sobre o Botafogo-SP fora de casa com uma vitória por 1 a 0. Entre 2015 e 2017 a equipe optou por não disputar essa competição, encerrando suas atividades profissionais logo depois do Estadual. Em 2018, voltou a jogar a Copa Paulista, mas foi eliminado na segunda fase.
As crises fora de campo também se refletiram no estádio municipal Bruno José Daniel. O descaso do poder público com o patrimônio fez o local ficar interditado por mais de um ano, entre 2011 e 2012, com o clube mandando jogos fora da cidade ou até mesmo com portões fechados. Depois de muitas promessas e atrasos, o estádio teve uma parte de sua arquibancada reconstruída, mas perdeu parte da capacidade anterior.
Na Copa do Brasil, o time do ABC Paulista jogou as edições de 2006, 2011, 2013, 2015 e 2017.
Para 2019, o Santo André contratou o treinador Fernando Marchiori (ex-Luverdense e Maringá-PR) para sair novamente da Série A2 do Paulistão. Com jogadores veteranos como o atacante Anselmo (ex-Palmeiras) e o meia Cristian (ex-Palmeiras), a equipe também aposta em suas promessas da categoria de base para voltar aos melhores dias.